Shalom,
"¡Bendito el que viene en el nombre del Eterno!" (Tehilim / Salmos 118:26 📖).
Bienvenido y gracias por enviarnos su interesante misiva.

Dos temas antes de responder a su pregunta.
La primera es que para hacernos llegar sus preguntas deben emplear el email que damos en la página de "Contacto" de este sitio. No aceptamos preguntas que nos remitan a través de comentarios, posteadas en el chat, etc.
La segunda, es que debe recordar que el ceremonial de la Havdalá es exclusivo para los Hijos de Israel, no debiendo el gentil incurrir en el tremendo error de usurpar este precepto que el Padre celestial ha dado en exclusiva a Su nación judía. Por otra parte, sería totalmente contradictorio que un gentil bendiga la Havdalá si tiene conocimiento del texto que se recita.
(Demás está recordar que los cristianos que se hacen llamar "judíos mesiánicos", "netzaritas" o similar, NO pertenece a la nación santa, y de hecho son antagónicos al Padre celestial en sus creencias y rituales).
El gentil hace lo bueno y justo cuando vive como noájida, como fiel al camino que el Padre celestial le ha concedido. Lea más al respecto en fulvida.com .

Pasando a su pregunta específicamente: la bendición de la fragancia para la Havdalá se hace sober cualquier aroma agradable, por ejemplo de clavo de olor, café, limón, hojas de árbol odorífero, perfume, etc.
Generalmente se agita el recipiente que contiene el aroma, como manera de desprender una mayor fragancia, no por cuestiones rituales o "mágicas".

Si le quedan dudas pertinentes, hágalas llegar.

Iebarejejá H’ – Dios te bendiga, y que sepamos construir Shalom.

Moré Yehuda Ribco